生物工程系成立于2010年，现有生物学、医学、药学、植物学、心理学等专业教师18人，其中硕士学位教师13人，院级学科带头人1人，骨干教师1人，拥有一支重视学科交叉，重视基础与应用结合，学术水平较高、治学严谨、思想活跃的年轻学术队伍。近年来承担省部级科研项目2项，并多次在全国、省市及学院组织的教科研活动中取得优异成绩。

生物工程系设有生物制药、发酵技术、化妆品制造与营销3个专业。其中生物制药专业为本系特色专业。现有在校生600余人，另有300余人在企业实习。近年来向社会输送了大量的优秀毕业生，这些毕业生受到用人单位的一致好评。

建系以来，本着以适应社会为宗旨，以就业为导向的人才培养目标，坚持产学研相结合，注重培养学生实践创新能力。积极响应国家及学院要求，逐步推进“工学结合一体化教学”改革，探索校企合作新模式，与多家企业建立了长期稳定的合作关系，为学生实习就业奠定了可靠的基础。